Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SgshQ9EQ08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms