Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mlst8Q9DCJ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms