Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med29Q9DB91 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med29Q9DB91 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms