Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402E13RikQ9D4D2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402E13RikQ9D4D2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402E13RikQ9D4D2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402E13RikQ9D4D2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402E13RikQ9D4D2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms