Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms