Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dhx30Q99PU8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx30Q99PU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx30Q99PU8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms