Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rrbp1Q99PL5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms