Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms