Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Alpk3Q924C5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Alpk3Q924C5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Alpk3Q924C5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms