Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep57l1Q8VDS7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep57l1Q8VDS7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms