Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20bQ8VCS3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20bQ8VCS3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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