Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Card11Q8CIS0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Card11Q8CIS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Card11Q8CIS0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms