Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ClmnQ8C5W0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClmnQ8C5W0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmnQ8C5W0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms