Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl3Q8BVF2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms