Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik4Q8BMF5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms