Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmd3Q8BHD4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmd3Q8BHD4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.8 ms