Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.6Q85ZW5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms