Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim17Q7TPM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms