Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Syne1Q6ZWR6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms