Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr13Q6R5N8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr13Q6R5N8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms