Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms