Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn2Q6PHP6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrn2Q6PHP6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn2Q6PHP6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms