Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Szrd1Q6NXN1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms