Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Secisbp2lQ6A098 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2lQ6A098 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms