Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atg9aQ68FE2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg9aQ68FE2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg9aQ68FE2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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