Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clcn1Q64347 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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Clcn1Q64347 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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Clcn1Q64347 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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Clcn1Q64347 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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Clcn1Q64347 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Clcn1Q64347 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Clcn1Q64347 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcn1Q64347 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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Clcn1Q64347 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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Clcn1Q64347 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcn1Q64347 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn1Q64347 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Clcn1Q64347 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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Clcn1Q64347 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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