Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nup62Q63850 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup62Q63850 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms