Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic3Q62521 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms