Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mre11Q61216 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms