Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf3Q60803 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms