Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trp53rkaQ5U452 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms