Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms