Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prkaa1Q5EG47 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms