Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otol1Q4ZJM7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otol1Q4ZJM7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otol1Q4ZJM7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otol1Q4ZJM7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otol1Q4ZJM7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms