Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain3Q3URJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nkain3Q3URJ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms