Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms