Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctu2Q3U308 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms