Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc10Q3TLI0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms