Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q08AU9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q08AU9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q08AU9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q08AU9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q08AU9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q08AU9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q08AU9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q08AU9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms