Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MitfQ08874 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MitfQ08874 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MitfQ08874 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms