Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms