Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm2aP59997 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm2aP59997 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm2aP59997 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Kdm2aP59997 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Kdm2aP59997 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms