Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc10P56960 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc10P56960 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc10P56960 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.1 ms