Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd1P52734 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms