Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmod1P49813 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmod1P49813 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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