Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb41P48193 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb41P48193 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.3 ms