Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd4P46935 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd4P46935 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd4P46935 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms