Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf1P46099 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klf1P46099 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf1P46099 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf1P46099 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms