Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5cP41230 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5cP41230 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms