Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms